《医学源流论》所论内容广泛，个人观点鲜明，医论多不过干言，但阐述透彻，富含哲理，耐人寻味。充分体现了徐氏尊从辨证论治的学术思想，及其博学识广与丰厚的临证积累。其中某些篇章，如“用药如用兵论”论说格外精彩，广为流传，被后世视为论药佳作。《医学源流论》是一部流传甚广且颇有影响的医论著作，对当今中医临床有较大的参考价值。