《神农本草经中药彩色图谱》共收载药物365种，分上、中、下三品，上品药120种，中品药120种，下品药125种，少数几种有附药。除考证不清的5种中药外，每种中药文字部分包括日文名称、本经原文、基原考证、形态分布、药材特征、功能主治；配图包括基原彩图（原植物、原动物、矿物）及药材、饮片彩图。全书共计彩图782幅。