吐娜主编的《民国新疆焉耆地区蒙古族档案选编》收录的档案史料均来源于巴音郭楞蒙古自治州档案史志局及和静县、和硕县、焉耆县等3个县档案馆的民国档案资料。其内容主要是民国时期南路土尔扈特和中路和硕特两蒙古部的社会、历史、经济、文化等状况。

《民国新疆焉耆地区蒙古族档案选编》所选的档案史料，依照内容进行了分类、编排，每类均按时间顺序排列。